Doujutsus sao os Kekkei Genkai ou Linhagem sanguinea avançada ocular,os possuidores de Doujutsus sao por regra Shinobis de nivel superior, têm quase sempre vantagem sobre o adversario graças a seu Doujutsu. 

As habilidades do Sharigan 1, é prever movimentos e copiar jutsus simples.

 

No nível 2, já consegue copiar alguns Jutsus mas não todos, o poder de antecipação aos movimentos também se torna melhor, e começa a conseguir ver o fluxo de chakra corporal, embora não tão bom como o Byakugan.

 

Já no nível 3, o Sharigan consegue copiar qualquer Jutsu de qualquer rank, até rank S, menos, claro, Kekkei Genkai's. A sua visão do chakra aumenta consideravelmente mais uma vez e é neste nível que o usuário começa a desvendar os verdadeiros poderes do Sharingan, o Genjutsu.

O próximo nível é o Mangekyou Sharingan. Pensou-se que este nível do Sharingan só era obtido por um meio, matar o seu melhor amigo, mas pode-se confirmar que está incompleta a informação, seguindo por exemplo o caso do Sharingan do Kakashi. Neste nível, o usuário pode utilizar os seus Jutsus mais poderoso com um simples cruzar de olhares. Para além disto, o Mangekyou Sharingan tem a habilidade de conseguir controlar a Kyuubi, não estando confirmado se também serve para o resto dos Bijuu's. Mas tem uma contra-partida: o uso excessivo do Mangekyou Sharingan pode causar cegueira ao seu utilizador. A forma do Mangekyou Sharingan muda sempre de utilizador para utilizador.

Requisito 1-Clã Uchiha
Requisito 2-Rank no Clã Uchiha de JOUNNIN

O último nível do Sharingan e actualmente o nível máximo conhecido, apenas se sabe que o único que o possuí é o Uchiha Sasuke. As principal característica deste Sharingan é o controlo total e completo do inimigo que vira uma autêntica marionete.

 

Byakugan é um Doujutsu que apenas membros do clã Hyuuga podem usar. O Byakugan deu origem ao Sharingan, assim como os Hyuuga's deram origem aos Uchiha's. Quando o Byakugan é ativado, o usuário ganha uma especie de "radar", ele tem uma visão de 360º ao seu redor, e pode ver até 50 metros para qualquer direção, assim podendo evitar ataques ou preve-los mesmo antes deles começarem. Mas o Byakugan tem um ponto fraco, um pequeno ponto que ele não pode ver, que é localizado mais ou menos na nuca do usuário.
Os membros do clã usam o Byakugan junto com seu chakra e criam o estilo de luta Juuken. Eles usam as palmas das mãos e emitem chakra nos corpos dos oponentes(nos pontos de tenketsu). Quando eles acertam o oponente com a palma de suas mãos, eles podem simplismente parar a circulação de chakra no corpo do oponente, assim, matando-o.

 

O Rin'negan é o mais venerado dos Doujutsus. O Rin'negan é caracterizado por um número de círculos ao redor da pupila do usuário, e este seu poder vem sendo dito é capaz de salvar ou destruir a terra. Diferente dos outros Doujutsus, este parece estar ativado todo tempo. Ele era usado pelo Eremita dos Seis Caminhos, dito o precursor de todos os Ninjas do Mundo e o criador dos primeiros Ninjutsus. Pein, o atual, e único, conhecido usuário desta habilidade, ativou-o na sua infância para salvar um de seus amigos. Pelo que Nagato (Pein) disse, Yahiko morreu há um tempo atrás, por isso que o corpo de Yahiko faz parte dos corpos que "compõem" Pein. Pein se fez supor que possui o poder da clarividência, e parece que esse Doujutsus permite mais de um Contrato de Sangue (talvez um de cada corpo que possua). Ele também tem vários outros corpos que varia dependendo da necessidade. O Rin'negan tem o poder de controlar todos os elementos e com isso, permite ao usuário utilizar qualquer Ninjutsu que quiser, até mesmo os de Invocação.